市农科院本部基地位于转塘街道洙泗路261号，占地面积97亩，2000年左右因珊瑚沙水库扩建原农科所搬迁至该处，2003年基本建设完成，建筑面积约1.5万平方米，现产权方为杭州市机关事务局，其中原科研培训楼由杭州市机关事务局出租 。2004年农科院成立时成为市农科院本部所在地。目前基地近40亩由园艺研究所、生物技术所、蔬菜所食用菌团队在基地开展相关科研工作。园艺所花卉研究团队主要利用基地开展杂交兰新品种技术研究保存有国兰、蕙兰等种质资源。园艺所果树团队主要从事甜樱桃新品种筛选和适栽技术研究，保存有甜樱桃品种。生物技术所主要开展三叶青、白及等中药材品种的种质创新研究，保存有三叶青、黄精等种质资源。蔬菜所食用菌团队主要开展桑黄等珍稀药用菌和秀珍菇等食用菌技术的研究。

通讯地址：杭州市西湖区转塘街道洙泗路261号。