农产品加工研究所主要承担农产品加工与质量安全、农产品综合利用、农产品保鲜及食品开发等方面的工作。现有科技人员8名，其中高级职称6人，建有营养健康食品中试试验平台，配备质构仪、色差仪、粘度仪、水分活度仪、风味分析仪、冷冻干燥机、真空干燥机、热泵型干燥箱、喷雾干燥机、流化床造粒机、双螺杆膨化机、多功能提取机、单效降膜浓缩机、高压均质机、超高温瞬时杀菌机、柔性无菌灌装机、多功能包装机、巴氏杀菌槽、反压杀菌器和烘焙室等一批先进设施设备，可开展固态（粉体、颗粒、压片等）和液态（饮品、果酒、浸膏等）加工产品中试试验及验证。

农产品加工所以区域特色农产品高值化利用技术开发为重点方向，以特色农产品、药食同源资源、地方“土特产”的开发利用为主要研究内容，在低盐风味食品加工、药食同源资源开发、加工过程生物活性减损等方面有较好的研究优势，在服务杭州西部山区特色农产品加工提质方面有良好成果积累。先后承担了国家自然科学基金、浙江省科技厅科技计划、杭州市科技计划、杭州市农业发展基金等各类科研与推广项目60余项，发表论文60余篇，授权发明专利20余件，出版专著1部，参与制定标准6部，研究成果获浙江省科技进步二等奖和三等奖、中国食品工业协会科学技术特等奖和一等奖、杭州市科技进步三等奖、省农业丰收三等奖和市农业丰收二等奖等市级以上奖励20余项次，为我市农产品加工科技进步、产业发展、乡村振兴和共同富裕示范区建设发挥了重要作用。